Aplikace

Fórum o projektu

Moderátoři: petnek, nenym, Zelvuska

Zpráva
Autor
Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

Aplikace

#1 Příspěvek od forest » stř 27 čer, 2007 07:27

RALPH má novou aplikaci 5.70
Tato aplikace má umožnit modelovat proteinové komplexy s různým druhem souměrnosti.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#2 Příspěvek od forest » úte 24 črc, 2007 07:22

RALPH má novou aplikaci 5.72. Tato verze opravuje chybičku v předchozí verzi a obsahuje několik nových instrukcí pro RNA.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#3 Příspěvek od forest » stř 01 srp, 2007 07:28

Vyšla nová aplikace 5.73. Opět opravuje pár chyb v RNA a doplňuje pár nových instrukcí pro vyšší rozlišení.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#4 Příspěvek od forest » čtv 09 srp, 2007 07:02

RALPH má novou aplikaci 5.74 ve které nadále pokračuje rozšiřování RNA.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#5 Příspěvek od forest » pon 13 srp, 2007 08:05

Včera vyšla nová aplikace 5.75 a hned ráno 5.76. Opět došlo k rozšíření RNA.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#6 Příspěvek od forest » úte 21 srp, 2007 07:24

A máme tu opět novou verzi, tentokrát 5.77.
Tato verze by měla opravit drobnou logickou chybu při ukončování řetězce výpočtu.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#7 Příspěvek od forest » pon 03 zář, 2007 07:27

Vyšla nová aplikace 5.78. Měla by urychlit průběh výpočtu, ale jako vždy se očekávají nějaké chybky.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#8 Příspěvek od forest » čtv 13 zář, 2007 07:19

RALPH vydal novou aplikaci 5.79, která ovšem již požaduje BM 5.8 a novější. Bylo v ní bohužel hned po startu nalezeno několik chyb v Linuxové verzi, takže pravděpodobně brzy bude následovat další.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#9 Příspěvek od forest » čtv 13 zář, 2007 07:37

Tak to byla rychlost, než jsem prolezl všechny weby a vrátil se zpět na RALPH, tak už tu máme 5.80 verzi která by snad měla být funkční i pro Linux.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#10 Příspěvek od forest » sob 27 říj, 2007 06:45

RALPH má novou aplikaci 5.81, ve které by měly být malá vylepšení protokolů pro citlivější zkoumání.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#11 Příspěvek od forest » pát 16 lis, 2007 16:06

Aplikace byla aktualizovaná rovnou na 5.84. Za menší zmatek v číslování se omlouvají. Změny v aplikaci by měly zahrnovat lepší diagnostiky pro různé druhy souměrnosti ('D2'), nový výstupní formát který může být užitečný pro design bílkovin a nějaká zlepšení v RNA struktuře výpočtů.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#12 Příspěvek od forest » pon 19 lis, 2007 17:41

Další nová verze 5.85, která dnes vyšla, by měla odstranit hlášené chyby, které jsou právě v té nové části okolo souměrnosti D2.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#13 Příspěvek od forest » pát 07 pro, 2007 05:44

Vyšla nová aplikace 5.86 pro Linux, která opravuje chyby v předešlé 5.85. Nyní by měly následovat pro MAC a Windows.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#14 Příspěvek od forest » úte 11 pro, 2007 08:06

Vyšla nová aplikace pro projekt a to verze 5.87.
Tato verze zahrnuje schopnost modelovat souměrné komplexy s novými druhy souměrnosti (D5) a obsahuje další vylepšení RNA.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#15 Příspěvek od forest » stř 12 pro, 2007 08:28

Byla vydaná nová verze 5.88, ve které jsou opraveny nedostatky z předchozí 5.87, takže kdo jedete stále s tou 5.87, dejte si reset projektu.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#16 Příspěvek od forest » čtv 13 pro, 2007 08:28

Další opravy nalezených chyb a také tedy nová verze 5.89.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

Re: RALPH

#17 Příspěvek od forest » čtv 20 pro, 2007 07:58

Máme novou aplikaci 5.90. Tato aplikace by měla snížit nároky na paměť, což pomůže hlavně slabším strojům zapojeným do projektu.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

Re: RALPH

#18 Příspěvek od forest » sob 22 pro, 2007 10:05

Byla vydaná verze 5.91 pro Linux, kde mají problémy s délkou výpočtů. Pokud budou brzo výsledky a nebudou další problémy, tak tuhle verzi přesunou do ostrého provozu.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17598
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

Re: RALPH

#19 Příspěvek od forest » pát 04 led, 2008 21:52

Po velice krátkém nasazení 5.92 je tu hned 5.93 verze, která má nějaká vylepšení v oblasti souměrnosti.

Saharak
5.26315789474 %
5.26315789474 %
Příspěvky: 32
Registrován: sob 12 kvě, 2007 09:59

minirosetta

#20 Příspěvek od Saharak » čtv 07 úno, 2008 00:29

Na projektu vydali novou aplikaci s názvem minirosetta. Ve stručnosti se jedná o objektově orientovanou verzi rosetty. Minirosetta vznikla přepsáním současné verze rosetty z fortranu do C++. Údajně je možno se s ní setkat právě na RALPH@home.
"Věřím jen těm statistikám, které sám zfalšuji." Winston Churchill

Odpovědět

Zpět na „RALPH@Home“